联系我们 / CONTACT US
0591-83441193
地址：福州市仓山区进步路25号
海洋青铜小单孢菌FIM 02-523全基因组测序及分析
{Author}: 方志锴；江红；林风；连云阳*；
{Author Address}: 福建省微生物研究所；福建省新药(微生物)筛选重点实验室；
{Journal}: 中国抗生素杂志
{Year}: 2018
{Volume}: 43
{Issue}: 11
{Pages}: 1364-1370
{Keywords}: M.chalcea FIM 02-523；全基因组测序；生物合成基因簇；Rakicidins；生物合成途径
{Abstract}: 青铜小单孢菌(Micromonospora chalcea, M. chalcea)FIM 02-523能够合成对乏氧肿瘤细胞、艰难梭菌等具有活性的环脂肽类化合物rakicidins。利用Illumina HiSeq高通量测序平台,本研究首次对M. chalcea FIM 02-523进行全基因组测序,得到总长约6.74Mb的序列信息。分析表明基因组GC含量为72.89%,包含了6167个蛋白编码序列。利用AntiSMASH预测基因组中存在19个生物合成基因簇。结合PKS/NRPS生物合成特征和rakicidins化学结构特点,定位到了rakicidins的生物合成基因簇,并初步推测其生物合成途径。研究为M. chalcea FIM 02-523的功能基因组学研究和代谢调控提供了理论基础。
福建省微生物研究所
地址： 福州市仓山区进步路25号 办公室电话： 0591-83441193、83476798
科技管理科电话： 0591-83309157、83586273 传真： 0591-83441193 邮箱： fim_cn@163.com